30 мая 2018 года Александр Карлин объявил на заседании правительства Алтайского края о отставке с поста губернатора. По его словам, в предыдущий день в Москве он отправил письменное заявление к президенту России Владимиру Путину с просьбой принять его отставку. В мае 2018 года прошел “губернаторопад” - сменились руководители Магаданской области, Якутии, Тюменской области и Ямало-Ненецкого автономного округа.
“Это решение принято совершенно добровольно и осознанно. Вы знаете, что по инициативе главы нашего государства сейчас в стране проводится существенное обновление состава органов государственной власти, в первую очередь речь идет об исполнительной ветви. В обновленном составе работает Правительство России, активно ведется ротация и обновление состава высших должностных лиц субъектов Российской Федерации. В этой ситуации я счел для себя правильным и своевременным обратиться к Президенту с указанным выше заявлением”, - заявил на заседании правительства Алтайского края Александр Карлин.
В тот же день, 30 мая Владимир Путин встретился с председателем правительства Красноярского края Виктором Томенко и назначил его временно исполняющим обязанности губернатора Алтайского края.
1 июня на церемонии представления врио главы региона Виктора Томенко экс-губернатор получил орден первой степени “За заслуги перед Алтайским краем” и поддержал нового руководителя края.
"Виктор Петрович начинает работу в новом качестве с хорошими стартовыми условиями. Он обладает очень достойным набором профессиональных и личных качеств. Я искренне убежден, что те задачи, которые ставит руководство страны перед нашим регионом, будут успешно выполняться. В завершение хотел бы всех попросить объединиться вокруг фигуры главы региона и сосредоточиться на содержательной, системной и серьезной работе", — подчеркнул Александр Карлин
18 сентября 2018 года по итогам губернаторских выборов, на которых победил Виктор Томенко, Александр Карлин был назначен сенатором Совета Федерации. В октябре того же года он стал зампредседателя комитета Совфеда по конституционному законодательству и государственному строительству.
В 2022 году сенатор Александр Карлин вошел в Парламентскую комиссию по расследованию обстоятельств, связанных с созданием американскими специалистами биологических лабораторий на территории Украины. Также политик активно участвует в работе временной комиссии по сохранению и развитию народных художественных промыслов.
